海南省城市足球联赛分为常规赛和淘汰赛两个阶段。
常规赛阶段分为南北两大区，北区涵盖海口市、儋州市、文昌市、琼海市、白沙县、定安县、临高县，澄迈县、屯昌县等9个市县，南区包含三亚市、万宁市、东方市、五指山市、陵水县、保亭县、昌江县，琼中县、乐东县等9个市县，两大区各9支队伍采用主客场单循环赛制，各进行9轮比赛，每轮8场球，共计72场赛事。每支球队将拥有4个主场和4个客场，签位号与主客场通过抽签确定。每场比赛胜者得3分，平局各得1分，负者0分。

常规赛过后，南北大区前四名的球队将晋级淘汰赛，赛区积分前
4名的球队晋级淘汰赛，以单场胜负晋级下一轮，直至决出最终冠军。